华中农业大学最早于1984年9月1日设立审计科。1989年6月28日，设立审计处。2019年4月，审计处更名为审计室，独立设置，与纪委办、监察室协同办公。下设财务与管理审计办公室和工程审计办公室,现有6人，其中高级技术职务4人。

华中农业大学审计室切实履行《审计法》和《教育系统内部审计工作规范》赋予的职责，结合学校管理需要开展财务与经济责任审计、工程审计、合同审计等各类审计工作。

审计室全体同志秉承依法审计、客观公正、监督评价、服务至上的宗旨，在认真履行监督、评价职能的同时，充分发挥服务功能，为防止学校经济风险服务、为保障教育事业健康发展提高教育资金使用效益服务、为学校干部队伍建设和廉政建设服务。坚持寓监督于服务之中，对学校各类业务活动及其内部控制的适当性、合法性和有效性进行审查、确认、评价和咨询，旨在健全学校内部治理，防范风险，提高学校资金资源的利用效益，从而促进学校事业目标的实现。